《鱼》是一部令人毛骨悚然的日韩动漫悬疑恐怖电影，讲述了女主角华织和她的两个朋友在冲绳海边旅游时发生的恐怖故事。故事开始于一个别墅，她们意外地发现了一条长着脚的鱼。尽管华织用桌子砸死并扔掉了它，但是那股腥臭味仍然弥漫着房间，而且鱼的尸体也神秘地消失了。
不久之后，女主角被那股尸臭感染，并最终死去。世界也被这些长有脚的鱼所占领，成千上万的人都受到它们控制，这是一个灾难性的故事。
动画版和漫画版《鱼》基本保持了相同的故事线索，只是对其中部分人物和叙事顺序进行了改动。女主角华织与好友亚纪、惠理香一起前往冲绳海边度假以庆祝毕业。他们意外地发现一种散发出恶臭气味并能够行走的步行鱼。随着时间推移，在冲绳附近海岸登陆步行鱼越来越多，华织开始担心她的未婚夫阿忠，于是她独自一人返回东京，却发现那里也已经变成了步行鱼的天下。
在飞机上遇到华织的记者白河为了获取更多关于步行鱼的信息，决定与华织一同前往寻找阿忠。经历了一系列与步行鱼生物激烈对抗后，他们最终来到了阿忠叔叔小柳教授的研究室。白河得到了小柳对步行鱼秘密武器的深入研究，并且在研究室里发现了被不明病毒感染的阿忠。
通过小柳口中得知，在二战期间日本曾经进行过秘密武器 步行鱼的研究，但是运载这些武器的舰船在冲绳附近海域被击沉。这种秘密武器还带有一种神秘病毒，在感染生物体后会产生大量气体从而推动步行机构运动。已经被感染并失去控制力量的阿忠刺杀了小柳，华织和白河紧随其后来到了大街上。
此时，绝大部分人都已经被感染，他们全身肿胀并不断喷出恶臭气体。华织的朋友惠理香变成了步行感染者，而亚纪则葬身于步行鱼池中。阿忠最终被其他感染者围攻而死亡，白河也受到了感染。最后只有华织一人幸存，并与其他未被感染者一起乘船离开日本。
然而，在电影的结尾处，步行感染者已经遍布全世界。面对这个充满恶臭气体的世界，华织只能轻叹着：“我已经习惯了…”