《机动战士高达UC》是一部日韩科幻动画，由古桥一浩、菱田正和、村田和也、京极尚彦、初见浩一、绵田慎也、远藤广隆和佐藤照雄共同执导。主演包括内山昂辉、藤村步、甲斐田裕子、浪川大辅和池田秀一。故事发生在第二次新吉恩战争之后，即宇宙世纪0096年，地球圈暂时恢复了和平。
然而，在过去的三年里，即宇宙世纪0096年，在工业殖民地工业7号上进行着一个秘密交涉。这项交涉内容是比斯特财团将最高机密——拉普拉斯之箱交给新吉恩残党军袖付。与此同时，在安纳海姆工业专门学校就读的少年巴纳吉·林克斯遇见了自称奥黛丽·本的少女（实际上是旧吉恩公国次男多兹鲁·扎比之女美耐巴·扎比）。奥黛丽为了阻止新的战争爆发，必须组织拉普拉斯之箱的交易。
在多次帮助奥黛丽后，巴纳吉逐渐被她所吸引。然而地球联邦察觉到这起交易，并进行军事介入，工业殖民地立即陷入火海。巴纳吉和他的伙伴们一边躲避危险一边寻找奥黛丽。与此同时，比斯特财团的首领卡迪阿斯·比斯特出现在他们面前。濒死的卡迪阿斯向巴纳吉透露了自己出生的秘密，并将机动战士高达独角兽——箱子之钥匙托付给他。接着，围绕着拉普拉斯之箱展开了一场战争……