《大祠堂》是一部以徽州府临源谢家的祖祠悌让堂为背景的国产古装剧。故事发生在男尊女卑的时代，女性们被禁足在祠堂之中。本剧围绕着一个女人展开，她从开始到最终走向未知结局。明朝末年，谢家长孙谢致卿和谢致成在新婚大典上发生了意外事故，给两个家族带来了不详之兆。郑秀云原本与青梅竹马的谢致成相爱，但误嫁给了他的哥哥谢致卿。不久后，致卿和致成一起出门经商，秀云开始漫长而寂寞地等待。
前后两个分支家族为宗祠掌权而斗争。前者将希望寄托在小儿子身上；后者则将长房长孙视作栋梁培养。两个家族之间的斗争逐渐明朗化。
秀云的父亲单芝盟被请来调解，并提出以演出劝善戏文化解决纷争。然而，在演出期间，秀云的小姑子玉芬私奔了。在平凡的生活中，秀云面临着一个个考验：早早地承担起家庭重任、小叔致相对她极度依赖、被找回来的玉芬要受到族规惩罚、丈夫带回了妾室和孩子等等。岁月流逝，谢氏族人陆续走完他们的人生旅程，在悌让堂举行告安祈福仪式。而被排除在祠堂之外的女性们默默地等待、劳作和祈求，青春逐渐消磨。
二十年过去了，秀云公公修撰了谢氏统宗谱。然而，在庆贺之际，后谢族人却对新谱提出质疑，并决定解决所有未决之疑。两个家族展开激烈斗争时，致成带来消息：李闯王进京并殉国，满洲铁骑入关。乡民们为国家前途忧心忡忡。
此时突然死而复生的致相出现在秀云面前，并带来满洲的政令：剃发。两谢的后生们决定杀死致相，三爷和秀才则为了谢氏一族的安危进退两难。一场盛大祭典成为谢氏一族向祖宗告别的悲情告白，大火烧毁了悌让堂，也送走了一个时代。
故事并未结束，秀云葬了公公后得到清朝皇上的旌表。她领旨前往府城与致相会面……
《大祠堂》展示了中华民族连绵不绝、中华文明生生不息的精神。这部作品代表着文化无尚价值和生命超越永恒。故事涉及复杂多样的人际伦理关系：恋人、叔嫂、夫妻、父子、妻妾、主仆等，在平实而自然流畅之中讲述着动人心魄的故事……